<!-- código -->
<head>
<!-- código -->
<style type="text/css">
<!-- Se modifica como desee la posicion del div que contiene el script de la página, por ejemplo, a la derecha -->
#linkwithindiv {float: right;}
</style>
</head>
<body>
<div>
<div>
aca va otro código
</div>
<!-- Dentro del body lo único que cambiamos respecto al código que puso es el id del siguiente div para manipularlo mediante CSS-->
<div id="linkwithindiv">
<script>
var linkwithin_site_id = 000000;
</script>
<script src="http://www.linkwithin.com/widget.js"></script>
<a href="http://www.linkwithin.com/"><img src="http://www.linkwithin.com/pixel.png" alt="Related Posts Plugin for WordPress, Blogger..." style="border: 0" /></a>
</div>
</div>
<!-- código-->
</body>
</html>