Fácil! Va al administrador de DNS en Godady y pones los DNS de tu hosting (en hostgator se pueden ver en la izquierda del panel) luego que le pones los nuevos DNS al dominio, vas al hosting y le das clic en addomine y ahí insertas el dominio en este formato: misitio.com y luego seleccionas un usuario y pass y le das agregar y listo!
Luego vas a administrador de archivos y ya veras la carpeta donde se suben los archivo... y si pones la URL muy posiblemente ya te salira la pagina de defecto, si no es asi espera un rato a que se actualice los DNS.
Para abrir una Email, simplemente vas a cuentas de Email y lo abres como cualquier otro Email, seleccionando el dominio que agregaste.