No se sí te entendí bien, pero aquí va mi solución en base a lo que entiendo.
Sí usas los mismos bloques para ambos blogs no sabrás a simple vista donde hicieron clics, yo creo bloques diferentes, en "Mis anuncios".
Por ejemplo:
El blog1 tiene bloques de nombre:
blog1 250x250 sidebar
blog1 250x250 Entre los posts
El blog2 tiene bloques de nombre:
blog2 125x125 sidebar
blog2 250x250 Entre los posts
De esa manera luego vas a "Informes de rendimiento" -> "Bloques de anuncio" y filtrás los los de un blog por un lado y los de otro por otro lado y sabés cuanto genera cada blog.
Desconozco la forma que menciona
Garlock, no entiendo bien los criterios de seguimiento, pero si los aprendes a usar deben ser interesantes.