Tal y como comentó el usuario jmnm, debes hacerlo una vez hayas activado las funciones avanzadas. Dado lo que mencionas, ahora mismo lo debes tener como "%%title%% %%home%%" o algo similar, entonces deberías eliminar lo último. En cuanto a como debería quedar, no es malo el cambio que quieres hacer, en muchas ocasiones no tiene sentido tener una/s palabra/s extra en el título, cuando en realidad con el título propiamente ya informas todo lo que tienes en mente.
Cuéntanos, luego, si pudiste resolverlo. Una vez lo cambies, en cuestion de unos pocos días deberían estar todas las URLs actualizadas en Google, dependiendo obviamente del tamaño y relevancia de la web. Con solo guardar la nueva configuración del plugin es suficiente, no deberás hacer otra cosa.