Pues si lo que pretendes es hacer tu web desde cero y solo usar las entradas del blog, pues es mas o menos lo que te han dicho, si lo que quieres es conservar las entradas, pues tienes que conservar sino toda la BD, pues si partir de la BD actual, y conforme vayas armando tu script, si es necesesario le vas cambiando la estructura o los nombres a los campos, marcado lo que no usaras para que una ves seguro que no los vas a usar pues proceder a eliminar esos campos.
Tambien puedes usar tu propia estructura en tu BD, sin embargo, para conserver las entradas, para eso igual tendras que saber como trataba tu CMS a la bd y posteriormente hacer un script que te saque solo las tablas y campos que pretendes usar en tu nueva BD y con el formato de tu nueva BD.
Todo dependera de que tanto sepas usar la BD del CMS que mencionas. Si tienes algo de experiencia con el manejo de SQL pues lo mejor seria lo segundo, crear tu propia estructura en tu bd y posteriormente sacar los datos de tu BD actual, generando sentencias con la nueva estructura. Si no tienes mucha experiencia, pues entonces usar una copia de tu BD en local y ahi irle haciendo los ajustes conforme lo vayas necesitando. Igual seria bueno ir conservado el historial de cambios en tu bd local, esto por si en tu bd publica siguen agregando contenido mientras desarrollas tu sitio en local, asi porteriormente podras descargarte una copia de la bd actualizada, aplicarle los cambios realizados y no perder las ultimas entradas publicadas.