Si la redirección la haces a través de javascript me parece que google seguirá tomando el error como 404. Podrías modificar la página que muestra por defecto How to Set Custom 404 Pages in Blogger | eBlogger Tips pero aún así la cabecera llegaría con 404 lo mejor sería que arregles esos enlaces a los que estás apuntando.
Ten en cuenta también los enlaces a sitios externos que pueden estar generando este error.