Sería manual eso, lo que entendí es que cambiaste la plantilla y ahora los videos son mas grandes que tu plantilla.
Lo que puedes hacer el hacer tus videos adaptables a cualquier dispositivo.
Puedes poner un css. antes de ]=]=></b:skin>
/* Youtube Responsive */
.videoyoutube{text-align:center;margin:auto;width:100%;}
.video-responsive{position:relative;padding-bottom:56.25%;height:0;overflow:hidden;}
.video-responsive iframe{position:absolute;top:0;left:0;width:100%;height:100%;border:0}
Esto antes de </body>
<script type='text/javascript'>
//<=!=[=C=D=A=T=A=[
// Youtube Responsive
setTimeout(function(){$(".video-youtube").each(function(){$(this).replaceWith('<iframe class="video-youtube loader" src="'+$(this).data("src")+'" allowfullscreen="allowfullscreen" height="281" width="500"></iframe>')})},5e3);
//]=]=>
</script>
Y editar cada entrada con video <div class="videoyoutube">
<div class="video-responsive">
<div class="video-youtube loader" data-src="//www.youtube.com/embed/
gyaYBG-0ifQ">
</div>
</div>
</div>
Lo que esta en negrita se cambia por la url del video. Por ejemplo
https://www.youtube.com/embed/gyaYBG-0ifQ quedaría como lo de arriba.
y esto iria en el html de cada post donde tienes tus videos.
<div class="video-responsive">
<div class="video-youtube loader" data-src="//www.youtube.com/embed/
gyaYBG-0ifQ">
</div>
</div>
</div>