En España las leyes se complican más que en otros países, hay varias opciones ha hacer, la primera como tu has comentado, es ser autonomo, pagando un cuota cada mes, y despues cada 3 meses como bien has dicho declarandolo todo, en la pagina online, tienes que tener unos textos legales etc..
Si no ya puedes crear una empresa, entonces es cuando tienes que pagar nominas, y a más tendrías queinscribir la web en el registro mercantil y todo eso, no soys asesor, te hablo de lo que tengo entendido a día de hoy, lo suyo seria que fueses a una asesoría para que te informe, y así que te lleve el tema de facturación etc..