Blogger te lo pone automáticamente en el lugar que ellos fijan, en cambio si creas el banner del tamaño color y lo pones donde quieras tienes la opción de ganar mas clics, muchas veces las ganancias dependen de la ubicación y tamaño de los banners.
No me di cuenta que queda incoherente. Me quería referir a que a nivel de implementación daba lo mismo uno u otro ... o sea que si usas el método manual no vas infrigir ninguna norma de Adsense.
yo la verdad desde blogger lo pondo desde la pestaña diseño y adsense lo coloca automaticamente igualmente tengo entendido que es lo mismo si pegas el código