HTML5 es sólo una version de HTML.
La w3c (organísmo encargado, entre otras cosas, de delimitar los estándares de los lenguajes web, y HTML en particular) lanzó HTML4.0 en los años noventa, y desde esa versión, no habían existido muchos cambios notorios, hasta la llegada de HTML5 (que no recuerdo cuando salio pero yo lo empecé a utilizar por ahí por el 2012.
Su llegada fue una revolucion: Nuevas etiquetas semánticas, nuevas funcionalidades, etc y uno de sus puntos más fuertes, fue la capacidad de Animar(con css3), reproducir audio y video sin ayuda de flash. Por ende, flash perdió mucho mercado, además los dispositivos apple, le quitaron soporte, pero en la web aun se puede utilizar, aun hay varios elementos hecho en flash, pero su caída ya es inminente. Si es algo que tienes hecho hace tiempo, puedes subirlo y todo, pero no vale la pena hacer más contenido en flash desde mi humilde opinion.
Espero haya quedado un poco más claro. Saludos!