Es un problema lo que planteas.
Pero todo se resume en el usuario y en las intenciones de búsqueda.
Si en la portada y en la landing se puede encontrar información parecida (similar intención de búsqueda), entonces vas a tener una canibalización asegurada y vas a perder mucha fuerza y posiciones.
Ejemplo:
HugeDomains.com - FontAnerIaenMadrid.com is for sale (Font Aner Iaen Madrid) debería atacar la KW "fontanería en Madrid" en la misma portada, sin landing específica. Sin embargo la web
fontanerias.com, lo lógico sería que hiciera una landing tipo
fontanerias.com y dejara la portada como vehículo para acceder a las distintas landings.
Todo depende, pero céntrate en nunca duplicar intenciones de búsqueda, que las cosas se encuentren en un solo sitio.