Es totalmente compatible con AdSense.
Tienes que entender algo, AN es una nueva teconología que está implantando facebook, entonces, cuando tú pinchas para leer una publicación pueden ocurrir dos cosas.
1. Que la publicación tenga la marca de Instant Articles y lees la publicación directamente en Facebook y se muestran los anuncios de Audience Network
2. Que la publicación no tenga la marca de I.A. entonces te lleva directo a tu web, donde tienes los anuncios de AdSense.
En ningún momento se juntan ambos anuncios, si hablamos de una web móvil.
O sea que son dos ecosistemas cerrados, al menos para web's pequeñas como las nuestras.
En web con trafico millonario es otra historia, pero como no estoy en ese nivel, no me he interesado por investigar el tema, ya veremos cuando llegue a esas ligas jajajjajajjja
Ahora bien si tienes una APP, es otra historia.