Los enlaces malos son los que están en otra temática, fuera de contexto, con texto a su alrededor que habla de otra cosa, o con texto que es claramente spam. Ejemplo: "visita esta web! dominio.com" es spam, pero "aquí hay más información interesante: dominio.com" no es spam. El primero no es natural, el segundo sí. La diferencia es sutil.
Y no, hacer SEO negativo no es rentable. Como dije, el tiempo que pierdes perjudicando a un sitio es el que dejas de ganar en mejorar el tuyo. Por otra parte, se hizo un experimento en trafficplanet con más de 1.000.000 de backlinks basura con scrapebox para tirar dos sitios conocidos de SEO, y ambos siguen teniendo PR4 y con incluso más visitas que antes.