Es altamente recomendado que efectúes la actualización por motivos de seguridad, solución de bugs, cambios en el diseño, entre otras cosas. Si actualizas a vBulletin 4.0.3, ten en cuenta que posiblemente vas a perder el estilo que utilices, si es personalizado, además, también es posible que algunos add-ons dejen de funcionar; tendrás que buscar en vBulletin.org las versiones más actualizadas.
Respecto a tu problema, esa es la causa conocida que genera ese error, claro está, si no has modificado por tu propia cuenta las directivas de seguridad del servidor. Asegúrate también de tener los permisos de todos los directorios del foro en 755, y los permisos de todos los archivos en 644.
Saludos.