Justo iba a entrar a mencionar eso. Es muy bueno ese plugin.
Como consejo, dejalo desactivado y en los artículos que quieras ponerlo agrega el código de [toc] porque en muchos artículos, al ser cortos, no hace falta la tabla (Si tenés algunos H1, H2, Etc.) y no es muy estético.
Yo lo tenía activado en todo, y decidí hacerlo manualmente, así elijo dónde.