Plugin para eso no conozco pero te dejo el código para que lo hagas tu mismo:
1. Entra al Index.php y debajo de <?php get_header();?> coloca esto <?php $i=0;?>
2. En el mismo Index.php busca la parte que dice algo como esto <?php while (have_posts()) : the_post(); ?>, debajo de eso coloca esto otro:
<?php
if($i==2)
{
?>
TU ADSENSE AQUI MISMO
<?
$i=0;
}
?>
3. Busca en el mismo Index.php esta parte <?php endwhile; ?> y justo arriba de esto coloca esto otro <?php $i++;?>
Te quedaría algo como esto:
+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
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+ ENTRADA
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+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
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+ ENTRADA
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Publicidad
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+ ENTRADA
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+ ENTRADA
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Publicidad
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+ ENTRADA
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+ ENTRADA
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Publicidad
Solo faltaría jugar con el CSS para darle un estilo bien bacano y hacer que solo se ejecute ese código 3 veces ya que solo se pueden 3 Banners de Adsense por pagina o te tocaria rotar los anuncios: Banner, Enlaces, Banner, Enlaces, Banner, Enlaces para que puedas colocar hasta 6 anuncios eso si te lo dejo a ti xD