Hola compañero.
Me temo que no es un virus.
Es simplemente un scam de posiblemente fraude de tarjetas de credito.
Usado por muchos hackers para pharming.
Te aconsejo, para empezar, que mires bien tu ordenador donde tienes esos datos al ftp, y que descartes cualquier virus.
Luego, que borres la cuenta de hosting y crees una nueva (obviamente con backup y todo, no creo que tardes mas de 15 minutos y asi te aseguras que este todo correctamente)
Y luego, obviamente, cambiar los datos FTP y del panel de administración.
Así, eso, no te deberia afectar nunca mas, decirte, que no creo, para nada, que te afecte a los keywords, a no ser que Google lo tome asi, pero lo dudo mucho