Organizando subcategorias e categorias em links de artigos

Me estoy encontrando un problema, y no se como solventarlo

En mi web tengo varias categorias, con sus correspondientes subcategorias. Al crear el enlace de cada articulo algunos se forman asi:

dominio.com/categoria/articulo.html

y otros se forman asi

dominio.com/categoria/subcategoria.html

Parece que la cosa es al azar, o almenos no detecto el porque. Puedo hacer que siempre el articulo se forme igual (lo ideal sera que fuera la segunda forma)

Edito para preguntar algo mas:

En el caso de que un post forme parte de distintas subcategoris y/o categorias, que url se indexa? Lo hace aleatoriamente?

Un saludo y gracias

Al seleccinoar las subcategorias, marcas tambien la casilla de categoria?

Si, marco las dos

Ya encontro la razon, y es que si seleccionas categoria lo indexa antes por categoria que por subcategoria. Arreglado

Ahora me surge otra duda, se podria impedir la seleccion de categorias, y dejar solo escojer subcategorias. Y rizando el rizo, se podria obligar a escojer solo 1 subcategoria?