Por que me aparecem arquivos duplicados index.php~

buen dia a todos, tengo una duda estoy abriendo un foro smf, luego de instalar varios mods y realizar una que otra modificación en archivos de la carpeta del foro, me han quedado varios archivos con el mismo nombre pero al final les aparece este signo: ~
ejemplo: index.php~
osea tengo el archivo index.php y otro que dice index.php~, he estado buscando y parece ser que lo mejor es eliminar el archivo index.php y renombrar el index.php~ a index.php, y así como este tengo varios archivos que les aparece al final ese signo ~.

Estos archivos , tienen en algunos casos más lineas de código que el archivo sin el signo ~, y en otros casos al revés

Por ahora no tengo problemas de errores, pero no sé si después en cuanto siga haciendo mas modificaciones aparezca algún error

Alguna sugerencia compañeros?

Esos archivos son backups que hace tu foro cuando instalas mods, es decir, que si algún día tienes problema con un archivo puedes utilizarlo. Yo recomiendo que no los borres.