Saludos, no soy un experto pero creo saber cuál es el problema, y es sencillo, lo que sucede según entiendo es que la FRECUENCIA DE MUESTREO de tu micrófono no es igual a la de AUDACITY, sin embargo, deben ser iguales, eso mismo me sucedió pero con Adobe Audition, te dejo un video de AUDITION donde puedes traspolar la misma idea: Solucion: Las velocidades de muestreo del dispositivo de entrada y salida de audio no coinciden. - YouTube
Es decir, en tu sistema operativo debes indicarle que al dispositivo de entrada tenga una FRECUENCIA DE MUESTREO DE 44,000 hz por ejemplo, entonces luego de haber configurado eso, que lo veras en el video que te compartí, debes ir a AUDACITY en el menú EDITAR / PREFERENCIAS, una vez abierta la ventana de configuración te vas a la pestaña CALIDAD y ahi le dejas en FRECUENCIA DE MUESTREO 44,100 hz igual que el micrófono en tu sistema operativo, y listo, ahora si vas a poder grabar con tu micrófono porque ambas frecuencias están a un mismo nivel.