En lo básico son lo mismo, pero Wordpress tiene cosas que la hacen ser el CMS más amigable a los buscadores y mejor para los visitantes.
Blogger no tiene muy buenos theme o plantillas, las que están bonitas son lentas, las que son rápidas lucen raras y tienen mal SEO, y así; y por defecto está el problema de que no puedes corregir el error de la caché pues eso lo maneja el mantenimiento de blogger.
Tal vez con blogger si se puedan hacer algunas cosas que hacen los plugin de Wordpress, pero eso ya sería un trabajo que requiere algunos conocimientos de programación, con los plugins Wordpress lo pone mucho más fácil y rápido.