No tengo anuncios, nisiquiera uso Adsense, pero
the_content(); muestra todo el contenido del post, éste está flotado a la izquierda, es por ello que al poner el anuncio arriba, el anuncio se "introduce" dentro del texto y queda bonito si le das un poco de margin al anuncio.
En caso de la parte inferior, al tener el anuncio por fuera del float del contenido, éste no se va a "abrazar" a tu anuncio.
Lo más práctico aunque más tedioso a la hora de editar que podés hacer es crear un shortcode con el código de tu anuncio, y mostrarlo al final del texto.
Algo como...
Lorem IpsumLorem IpsumLorem IpsumLorem IpsumLorem IpsumLorem IpsumLorem IpsumLorem IpsumLorem IpsumLorem IpsumLorem IpsumLorem IpsumLorem IpsumLorem IpsumLorem IpsumLorem IpsumLorem Ipsum [Mi_Shortcode_Adsense]
Esto obviamente lo tendrás que poner dentro de cada post, por ello lo de tedioso (aparte de que en los viejos posts no se mostrará, pero podés investigar un poco más como incluir dicho código dentro de
the_content();
Para crear shortcodes, lo podés hacer
desde acá, fácil y rápido.
Saludos.