Este sería el proceso para realizar la actualización, tal y como lo explican en vBulletin.com (Tradución un poco libre 
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Actualizando desde una versión anterior de vBulletin 3.x
Antes de nada, crea una copia de seguridad de tu base de datos y también una copia de todos los archivos de tu foro. Sólo para prevenir.
Cierra tu Foro desde el Panel de Administración (admincp).
Sube todo los archivos de la carpeta 'upload/' que hay en el zip, con la excepción de 'install/install.php'. Abre la carpeta 'upload/includes/'. En ella, busca el archivo llamado config.new.php. Renómbralo a config.php y ábrele con un editor de texto. Configúralo igual que tenías el antiguo config.php, del cuál habías hecho una copia de seguridad.
Abre tu navegador y escribe la URL de tu foro, http://www.example.com/forum/install/upgrade.php (donde www.example.com/forum/ es la URL de tu Foro). Ahora se ejecutará el script de actualización y comenzará el proceso.
Sigue las instrucciones de pantalla. Asegúrate de hacer clic en next step o proceed hasta que seas redirigido a tu Panel de Administración. Ahora puedes reabrir tu Foro.
Para una completa descripción de como actualizar a la última version, ve upgrade section del vBulletin 3 Manual.
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Actualizando desde una versión anterior de vBulletin 3.x
Antes de nada, crea una copia de seguridad de tu base de datos y también una copia de todos los archivos de tu foro. Sólo para prevenir.
Cierra tu Foro desde el Panel de Administración (admincp).
Sube todo los archivos de la carpeta 'upload/' que hay en el zip, con la excepción de 'install/install.php'. Abre la carpeta 'upload/includes/'. En ella, busca el archivo llamado config.new.php. Renómbralo a config.php y ábrele con un editor de texto. Configúralo igual que tenías el antiguo config.php, del cuál habías hecho una copia de seguridad
.Abre tu navegador y escribe la URL de tu foro, http://www.example.com/forum/install/upgrade.php (donde www.example.com/forum/ es la URL de tu Foro). Ahora se ejecutará el script de actualización y comenzará el proceso.
Sigue las instrucciones de pantalla. Asegúrate de hacer clic en next step o proceed hasta que seas redirigido a tu Panel de Administración. Ahora puedes reabrir tu Foro.
Para una completa descripción de como actualizar a la última version, ve upgrade section del vBulletin 3 Manual.
