Si eres particular teoricamente no puedes facturar ni cobrar ya que debería aplicar IVA, esto ya en el aspecto legal. También cabe destacar la diferencia entre autonomo como profesional que como cotizante de hacienda.
Dicho esto, aunque te cobren comisiones, no pongas metodos de pago raros o se echaran atrás muchos clientes. Toda plataforma te cobrará una comisión de entre el 1-4%. Lo normal es usar Paypal + TPV (datafono virtual para tarjetas). Merece la pena, te recomiendo que no escatimes en eso.
Un saludo,