con solo cambiar una letra de la url que toma facebook en los comentarios (desde el codigo, no desde la barra de url del navegador), facebook ya lo toma disinto... y perderas todos los comentarios... y no hay forma de mudar a otra url... por eso es mejor dejar la vieja url y mantener los comentarios. de igual manera uses http o https no afectara los comentarios (dejando siempre la misma url...)...
Ejemplo:
PHP:
<div class="fb-comments" data-href="http://misitio.com/post1.html" data-numposts="5"></div>
con que no cambies el http y los dejes como hasta ahora, no perderas los comentarios...