Yo encuentro las siguientes ventajas y desventajas:
Hosting y Dominios JUNTOS:
-Ventajas:Se controlan todos desde un mismo panel. Entrando en tu proveedor puedes ver facilmente cuando caducan, que todo va bien etc...
En caso de tener algun problema que involucre hosting y dominio, es más fácil que te lo resuelvan.
-Desventajas: Desaprovechas ofertas de renovacion de dominios de otras plataformas.
En caso de crecer como hosting debes migrar hosting + dominios.
En caso de Dominio + Hosting SEPARADOS, lo mismo pero a la inversa.
En mi caso, por unos pocos euros que te ahorras cambiando todo el rato de proveedor de dominio no merece la pena. Y lo del crecimiento del hosting si que es una lata pero se cambia cada mucho tiempo, al menos en mi caso. Yo por ahora me quedo con Hosting + Dominios con el mismo proveedor.