No soy experto en SEO, pero desde mi punto de vista lo estás haciendo mal, las tags se deben de usar con cautela, pon las tags solo en la sección de wordpress y con all in one seo configuras para que se indexen siempre y cuando no satures de tags tu sitio porque sería contraproducente, si consideras que puedes llevar un buen control sobre tus tags lo mejor es indexarlas, pero si por ejemplo en un articulo de una receta de una ensalda pones las tags: tomates, cocina, receta, aceite, oliva, lechuga, etc, vamos; saturas como si fueran keywords y no eres coherente mejor no uses tags y no las indexes. 🙂