No especificas muy bien pero bueno es fácil manejar ffmpeg en widows, eso si es para un vps con linux ya es otro cuento, pero para windows es simple:
1. Bajas el ffmpeg y lo guardas en una carpeta.
2. Abres el cmd de windows, inicio -> ejecutar o inicio + R escribes CMD y enter
3. nos dirigimos a la carpeta donde esta el ffmpeg y el vídeo no importa el formato.
de la siguiente manera cd carpeta_donde_esta_el_fmpeg
EJEMPLO.
Yo descargue el ffmpge y cree una carpeta en el escritorio llamada C:\Users\FAMILIA\Desktop\ffmpge
Entonces quedaría así:
Resumen:
1.Bajo el ffmpeg y lo guardo en una carpeta con el video
2.Abro el cmd de windows.
3. busco la carpeta donde tengo los archivos, ejemplo: cd C:\Users\FAMILIA\Desktop\ffmpge y enter
4. ejecuto el comando ffmpeg -i video1.wmv salida.gif
5. Espero a que termine.
En este caso el vídeo se llama video1.wmv y la salida del gif llamada salida.gif
Pd: también se puede hacer por medio de un loop para que haga lo mismo con varios vídeos pero no recuerdo como se hace.
Saludos y así con todos los comandos.