No necesariamente menos anuncios represantan clicks mejor pagos.
Mas que pensar en lo que te pagan por click yo pensaria en cuanta ganancia genera un sitio entero. Un ejemplo claro de eso puede ser que al sacar un bloque de anuncios en el otro aumente la cantidad de clicks, pero esa cantidad de aumento no cubre los ingresos que generaba el anuncio que sacaste, entonces tenes clicks mejor pagos (suponiendo que dejaste el anuncio con clicks mejores pagos) pero menor cantidad total de clicks con lo que tus ingresos bajaron.
Saludos.