Puede que los títulos sean parecidos o tengan contenidos comunes todas las páginas. Google solo indexa url's canónicas, si son todas parecidas o guardan relación no indexa todo, solo las más relevantes (y a veces, como en tu caso, nada) si considera que el contenido no es muy importante como para aparecer en sus búsquedas.
Para que te hagas una idea de lo que digo, bajo mi propia experiencia, tengo una página que me indexa todo en relativamente poco tiempo y otra que me ocurre igual que a ti, ni tan siquiera me ha indexado la portada principal y, curiosamente, se dan estos factores.
También, si lees los
FAQ de Google a este respecto, te indica que indexa el contenido poco a poco, es decir, es mejor mandar a indexar tu página principal y, en función de la respuesta que va recibiendo (búsquedas/visitas) sigue indexando contenido al recibir cierta relevancia. En tu caso veo que pretendes indexar además 1,2 mil páginas, algo muy poco aconsejable por temas de spam y lo anteriormente mencionado.