Esto ya me parece muy extraño... ¿Con el theme por defecto de WP y con el disqus desactivado sigue igual? ¿Alguna vez hiciste alguna modificación al código del theme (o al comments.php)? ¿Hay algún otro plugin que tengas instalado que interfiera con los comentarios?
Yo desactivaría todos los plugins (por si acaso alguno este interfiriendo en el display de los comentarios) y con el theme por defecto (twenty lo que sea) a ver que pasa...
Si tampoco da resultado, haría la reinstalación de WordPress.
Si con todo eso no anda, no sé, es algo que está embrujado jaja
Me fijaría de nuevo en las tablas, después intentaría hacer un debug para ver porque te sale que los comentarios están cerrados si en la tabla tenés que están abiertos... eso es lo raro, ya que es una simple query con el post id :S
Slds.