Parece que es un error por parte de Adsense pero aseguran que no hay problema:
Hola a todos!
Para aquellos editores que hayan encontrado en su cuenta el balance en negativo, pueden verificar que en su historial de pagos el mismo aparecerá normal, por lo que no deben preocuparse ya que se trata de un pequeño error que no afectará a los pagos y cobrarán normalmente.
En los casos en que se encuentren con descuentos por tráfico no válido será diferente, ya que esos son descuentos que no se van a pagar.
Fuente:
https://productforums.google.com/forum/#!topic/adsense-es/LTQCgMOFE9g;context-place=forum/adsense-es