Hacer una página web y desarrollar un proyecto son dos cosas muy distintas, la mayoría de esos programas sirven mas que todo para lo primero: para crear un diseño visual, subirlo al servidor y eso es todo ¿Qué tal si se necesita que esa web sea administrable? ¿El código de esa web es ordenado, reusable? por lo que he visto sería doble trabajo tratar de reusar ese código, es decir, la web creada en esos programas solo serviría como prototipo, eventualmente tendría que volverse a trabajar toda con algún lenguaje de programación para que el contenido esté correctamente organizado en una base de datos, ésto último es muy importante si posteriormente se necesita consumir el contenido desde una aplicación ajena a la página web, como una app por ejemplo. O también para implementar sistemas que interactúen con el contenido como buscadores, filtros.
En fin, cuando se desarrolla un proyecto siempre hay que tener en cuenta la escalabilidad, uno nunca sabe que camino va tomar el proyecto y esto es lo que diferencia a un trabajo profesional a un trabajo hecho en un fin de semana. Para prototipos Adobe Muse puede estar perfecto, pero un prototipo es apenas un 10% de un proyecto.