Te recomiendo TweetDeck o Seesmic. Ambos muy buenos y completos. Tienes la opción de integrar varias redes sociales o varias cuentas de una misma red social, realizar búsquedas temáticas y guardarlas en columnas, por lo que puedes estar al tanto de temas específicos que te interesen.
La mayoría de los clientes de escritorio ya tienen esa característica, pero TweetDeck y Seesmic están, por mucho, a la cabeza, aunque el uso de HootSuite está avanzando. La ventaja de TweetDeck es que es un cliente completo, gratuito y multiplataforma. Así que, para mí es la más recomendable.
Yo uso ése para gestionar cuatro cuentas Twitter, mi cuenta Facebook y ya integra otras redes como Buzz, si es que usas esa.
Saludos y suerte.