No, no se resetea. Debes entrar a tu search console, ir a pestaña sitemap. pincha arriba del sitemap que quieras eliminar, y en la esquina superior derecha de esa pantalla, al lado donde pone (abrir sitemap) ves 3 puntitos en vertical. Ahí es donde puedes retirar el sitemap.
Tiene en cuenta que si solo quieres eliminar el site map de categorías o de etiquetas, desde el Yoast deberás poner tanto categorías como etiquetas como Noindex (o no mostrarlos en los resultados de búsqueda. Para eso vas a Yoast/ajustes/categoría y etiquetas/ y en cada pestaña correspondiente deshabilita mostrar categorías en los resultados de búsqueda.
Pero si quieres eliminar todos los sitemaps, vas a sitemap en search console, pincha en /sitemap_index.xml y en los 3 puntitos verticales, eliminas todos.
Para enviar otro nuevo, configura bien el Yoast. Para eso vas a ajustes/características de sitio/al final de esta sección donde pone Mapas del sitio XML desactiva. Va por sección en sección configurando y al final en vuelves a mapas del sitio XML y activa. Confirma que el site map está como deseas.
Si has eliminado todos los sitemap, vuelves a serach console y en sitemap le pegas el sitemap. Algo así como esto: "sitemap_index.xml"
Espero te sirva de ayuda.
Saludos