No necesariamente tendrías que perder posicionamiento. Tal vez te puede llegar a beneficiar, dependiendo de qué theme instales. Además del rendimiento, un cambio de theme podría modificar la estructura interna del sitio y entrar en juego diversos factores técnicos.
Lo mejor que podrías hacer, es llevar un control del los cambios en las SERP's y los cambios a nivel SEO onpage. Si ves que sales perjudicado con la nueva plantilla, vuelve a la anterior o busca otra mejor. Aunque lo ideal sería que no estés cambiando de theme con tanta frecuencia.