Si claro que podes, de hecho si tenes una plantilla vieja es el mismo procedimiento que para un sitio cualquiera, pegas el codigo antes del </body> y listo.
Si tenes una plantilla de las nuevas que ofrece blogger.com podes seguir estos pasos que publique en mi blog, donde google mejoro y facilito la integracion con analytics con una sola linea en el panel donde ingresas tu codigo.
Como indico ahi, las estadisticas pueden y seguro seran distintas, porque usan sistemas distintos para medir el trafico
Ahora los bloggers de blogger.com podrán integrar fácilmente un sistema más completo de estadísticas como Analytics y sin la necesidad de incrustar el codigo que brinda en el html del template, para ello tendran que ir a su panel de blogger y en el menu configuración usar la ultima opción ”Otros”, al final encontraran un campo como el de la imagen donde deben introducir el codigo asignado para el blog en Analytics.