Dúvida ao Organizar meus Sites na minha hospedagem

Buen día amigos del foro, tengo una cuenta en bluehost multidominio, empeze con una página "x1" que la subí al FTP y todas las carpetas está dentro del public_html (osea las carpetas de mi web como css, js, asi....), pero ahora tengo 2 webs más "x2" y "x3" y están combinadas con las demás carpetas de la primera web "x1" no sé si me dejo entender...😕 esta bien hacerlo así?, afecta al seo tenerlas en ese orden? (o desorden mejo dicho :topsy_turvy🙂 espero sus respuestas!! Saludos!!

No, no te afecta en nada.

puedes crear carpetas diferentes a tu pagina inicial, es decir no es necesario meterlas dentro de public, yo solo tengo mi pagina principal en la carpeta public htlm, y las demas estan en carpetas independites y no he tenido problemas.
me parece que le da mas orden y no mesclas carpetas y archivos de tus paginas web

gracias por responder amigos, mi intención es ponerlas en orden, [MENTION=110655]kharel[/MENTION] me podías decir como haría eso?, yo soy novato y tengo entendido que si no publico en public_html las carpetas no se verían en internet...a ver si saco esas carpetas y los pongo en la misma lista que public_html, (osea ya no estaría dentro, sería su compañera), a eso te refieres?...:s