Esa herramienta solo indica la parte superior de la página, no somos tan tontos como para no saber eso jeje.
Si no estuviera esa linea roja igual nos damos cuenta, abrimos el navegador y vemos la parte que se ve, incluso es mejor usar ScreenFly analizándolo con las resoluciones que tengamos en las estadísticas de analyitcs.
No voy en contra de tu comentario, sino por Google, parece que nos trata como tontos.
Yo he descubierto que en uno de mis sitios funciona mejor con el banner cuadrado de 326x280 en medio del texto debajo del título, así como un banner horizontal 728x29 debajo de mi header entre el body, me funciona de maravilla, el CTR y mi RPM andan mejor que antes.