Qué difícil situación.
Si ya te ha pasado varias veces, el problema no es Facebook o la aplicaciones de autenticación, probablemente el problema son tus dispositivos, o programas, apps, incluso las extensiones de Chrome. Hace algunos meses una extensión que siempre usaba para descargar videos estaba usandose en segundo plano para instalarme cosas y colocarme publicidad en el pc y en Chrome. Así que duda de TODO.
Yo de ti formateaba totalmente el pc; inviertes dinero en una licencia original de Windows y un antivirus, que por cierto las venden aquí en el foro más baratas.
Te tocará hacer una limpieza exhaustiva de todo porque si eres víctima recurrente, es porque eres un blanco fácil.