Hola, no te preocueps por eso, si no hiciste nada raro o realmente abusivo no paso nada, es comun. Segun tengo entendido en algunas charlas de SEO que vi, al indexar una web nueva, google lo toma con un PR neutro interno (algo asi como que te toma en un promedio normal). y luego rankea despues de x dias y te posiciona en donde debes estar. Lo que ha pasado es que inspecciono tu web, y tardo en rankearla, por lo que de golpe apareciste en una parte de google, sin que el crawler te haya investigado bien la web, y lueog de que se dio cuenta de que es nueva, chica, y demas. Te mando atras, esperando backlinks y contenido abundante para la proxima vez que pase y mida las cosas para rankearte.
Ya si pasas muchas semanas sin aparecer ahi si es otra cosa, pero por webmaster tools siempre te avisan cuando lago hiciste mal.