Existen formas específicas para saber si estas o no penalizado. ¿Te ha bajado el pagerank? ¿Tu web ya no aparece en google?, prueba haciendo la busqueda site:tusitio.com ,,,
En estos últimos días google está algo haragán para indexar nuevos contenidos, y es algo que sucede devez en cuando... Y ten pendiente que no todo lo que te indexa aparecerá por encima de otros resultados sin trabajarle al posicionamiento,,,