aishhh que lió yo por eso nunca recomiendo el cambio de theme, plantilla o como lo quieran llamar xD, y esto por que Andres128???
Bueno es que cada theme tiene su estructura y orden interno me refiero a su código html, nombramiento de divs, jerarquía, velocidad de carga, diseño responsivo, elementos, javascript y pues cada programador lo arregla diferente en cuanto a seo algunos los optimizan otros NO...
Google inicialmente indexa un sitio web con X plantilla, procede a revisar su código html (me imagino que su robot lo hace o personal humano lo dudo), le realiza sus diferentes pruebas de rendimiento, orden visibilidad bueno son muchas cosas, obtiene el contenido del articulo verifica que no este repetido, mira sus backlinks y finalmente toma su determinación de subirlo o no de posiciones dependiendo de la palabra clave puesta en el title o <h1.... También no cambiar la estructura de los enlaces en wordpress por que eso genera 404 siempre tener el mismo y dejar eso quieto.
Puede pasar que al cambiar de plantilla y al regenerarse un nuevo cache google hace otra vez su revisión y esta vez no le gusta lo que encontró y pues lo baja de posiciones simplemente se caen las visitas....
A que voy con esto es mejor tener una sola plantilla bien optimizada para todos los sitios y ya evitarse dolores de cabeza de actualizar... También puede ser debido al cambio de http a https pero bueno se arreglara con el tiempo, también tener cuidado con esos 404 no se ven bien...
Ya lo otro mirar el Google Search Console de pronto se vea un horizonte desde allí....