Si ya cayeron las visitas tantos días, no creo que puedas recuperarlas. Lo mejor sería que te centres en solucionar los problemas que te muestra en webmaster tools y trates de volver a posicionar como antes.
El problema en estos casos es que, aunque tengas mucha experiencia, nadie conoce el funcionamiento exacto de los algoritmos de Google, y surgen cosas inesperadas. Lo mejor no hacer cambios tan drásticos si la cosa va bien, y si es necesario, contratar a un experto que se haga responsable.