Como ya te comentaron, sin ver parte del codigo es imposible. No es necesario ni que nos pases todo ni tampoco que lo ejecutemos. Solo las partes mas importantes.
A
AG524
Alfa
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Utiliza promesas, es lo mas fácil para detectar cuando un código ha fallado.
Cabe resaltar que el hecho que ese contador sea parte de todo un sistema no hace que sea 100% requerido para que otros lo evaluen, solo extrae el código necesario para reproducir el problema.
Puede servirte revisar la forma en que el contador hace que cambie el valor en el div, si puedes modificar la función que realiza el cambio en ella puedes definir qué va a suceder cuando termine de ejecutarse, si no puedes modificarla puede que haga falta crearla tu mismo, es decir, replicar el funcionamiento actual de la función y entonces controlar todo el flujo del contador.