Desde hace unos días hay mucho movimiento, no eres el primero en notarlo. Se habla de un update, pero parece que está corriendo en los resultados en español, porque de EE.UU no he leído que noten algún cambio.
¿Quizás BERT ha empezado a andar por aquí? No sé, solo sé que hay movimientos fuertes.
La penalización recuerda que no solo es manual, sino algorítmica. Simplemente puede ser que el algoritmo esta vez te "penalizó". Pongo las comillas porque no es que tenga que haber algo mal con tu web, simplemente Google está tomando en cuenta cosas de las que no tenemos idea y otras webs salen beneficiadas.
Igual son solo especulaciones. Revisa bien los resultados de Search Console para que compruebes si realmente el tráfico perdido es orgánico, comprueba quién subió por encima de ti, fíjate en qué tienen, etc. Suerte!