Todo depende de lo que hayas activado, en el panel de control del administrador en Storage-Almacenamiento tienes varias opciones
Para los avatares puedes almacenarlos en base de datos o en file system.
Los css puedes almacenarlos en base de datos o en filesystem.
La diferencia es básicamente de tiempo, las imágenes en mysql son campos blob (binarios) y cuando tienes unos cuantos avatares ralentiza la carga. Siempre es más rápido desde el file system (osea disco duro)
Los css también son mucho más eficientes desde el disco duro.
Lo único que tienes que hacer es crear una carpeta donde los quieras almacenar, y darle permisos de todo chmod 777 carpeta, luego para que no todo el mundo pueda subirte cosas le cambias el dueño de la carpeta al usuario con el que arranca apache, chown -R apache carpeta
te vas a las opciones de configuración y metes la ruta a tu carpeta copiando la salida de pwd desde tu consola
