A que te refieres exactamente como blogs independientes? creo que si al final de cuentas se enlazan entre ellos y comparten DNS y demás, viene a ser practicamente lo mismo, es decir, google los relacionara como si fueran del mismo dueño, incluso por el analytics, google adsense, etc...
Ahora bien si le llamas blogs independientes a:
Diferentes DNS
Diferente Adsense
Diferente Analytics
y simplemente intercambias enlaces...
Entonces creo que si podrían pasar como si de diferentes usuarios se tratara, sin embargo seria todo un lio y más costoso.
Entonces y en conclusión, blogs independientes creo que es un termino demasiado complicado para llevarlo a la práctica.
Saludos